در مصاحبه ای با آنتونی دنسلو، موریسون گفته است: "سخنان نادرست بسیاری درباره این آلبوم بیان شد. من هیچ گاه وابسته به گروهی نبودم و چنین قصدی نیز ندارم. برای کسانی که نمی دانند راهبر و هدایتگر چه کسی است باید بگویم حتی معلمی نیز نداشتم." سال 1987 آلبوم "ترکیب قهرمانان شاعرانه" وی با تمی عاشقانه و رومانتیک، شامل آهنگهایی همچون: "کسی مثل تو" و "بوسه فرانسوی" (مربوط به سال 1995) که در این آلبوم اجرا شد.

"طلوع جزیره آوالون" آلبوم سال 1989 موریسون که در مقام 13 رده بندی آلبومهای انگلستان جای گرفت.

در سالهای 2000 موریسون به سفر و ضبط آثارش ادامه می داد که اغلب سه اجرا در هفته داشتند. وی برچسب (کمپانی پخش) شخصی و مستقل خود را به وجود آورد که او را قادر می ساخت تا کنترل و حقوق کامل هر آلبوم را دارا باشد.

آلبوم "پائین جاده" عرضه شده در ماه مه 2002 نقدهای خوبی دربر داشت و یکی از بهترین آلبومهای وی در جدول رده بندی آمریکا بود. این آلبوم با داشتن پانزده آهنگ و هر کدام با ژانرهای مختلف (از جمله سبکهای بلوز، محلی و فولکلور)، مایه ای غریب و نوستالژیک داشت. او یکی از آهنگهای این آلبوم را به پدرش جرج تقدیم کرد، شخصی که نقشی اساسی را در پرورش سلیقه موسیقی اش در دوران کودکی داشت.

آلبوم بعدی موریسون در رده بیست و پنجم بر روی بیلبورد آمریکایی 200 آلبوم برتر جای گرفت که چهل سال از اولین باری که موریسن به عنوان مرد اول به همراه گروه "Them" بر روی سن حاضر شد می گذشت. مجله رولینگ استون این آلبوم را در رده هفدهم جز 50 آلبوم برتر سال 2005 قرار داد.

همچنین آلبوم "زمان جادویی" در جولای 2005 از طرف وب سایت آمازون (Amazon.com) به عنوان بیست و پنجمین پرفروش ترین آلبوم انتخاب شد. در اواخر همان سال موریسون یکی از آهنگهای خود را به آلبوم خیریه ای به نام "دور هم اکنون جمع شویم" بخشید که پول حاصل از فروش این آلبوم برای کمک به بازماندگان توفان سال 2005 کاترینا و ریتا استفاده شد. این آهنگ "آبی و سبز" نام داشت که موریسون آن را ساخت و فوگی لایتل (Foggy Lyttle) گیتاریست آن بود.

این آهنگ در آلبوم سال 2007 وی به نام "بهترین آثار وان موریسون مجموعه 3 "جای گرفت. این آلبوم شامل سی و یک آهنگ بود که هیچ کدام پیش از این به طور رسمی عرضه نشده بودند. وان موریسون مرد اول جشنواره موسیقی سلتی در تابستان 2005 بود. در 7 مارچ 2007 آلبوم "به شیطان بپرداز" (Pay the Devil) وی با قالب موسیقی محلی عرضه شد.

این آلبوم در رده بیست و ششم 200 آلبوم بر روی بیلبورد و هفتمین آلبوم برتر کشور آمریکا شناخته شد. در اکتبر 2006 اولین DVD تجاری خود به نام "زنده در مونترئوکس" 1980/1974 عرضه کرد که شامل کنسرتهایی وی در جشنواره موسیقی جاز مونترئوکس بود. آلبوم "هنوز در اوج" شامل سی و هفت آهنگ بر روی دو CD در 22 اکتبر 2007 در انگلستان با برچسب پولیدور عرضه شد.

این آلبوم در رده دوم 75 آلبوم برتر بریتانیای کبیر واقع شد. سی و سومین آلبوم موریسون به نام "ساده بگیر" (Keep It Simple) اثری متفاوت که در 17 مارچ 2008 در انگلستان و در 1 آوریل همان سال در کانادا و آمریکا با برچسب ضبط شخصی خود وی پخش شد. در اولین هفته این آلبوم در مقام دهم بین 200 آلبوم برتر جای گرفت.